多系統萎縮症は、複数の遺伝的要因、環境的要因、およびライフスタイル要因の相互作用によって引き起こ これらの要因を抽出しが多く不明である。
いくつかの遺伝子の変化は、多系統萎縮の可能性のある危険因子として研究されている。 最も多くの証拠を持つ遺伝的危険因子は、SNCAおよびCOQ2遺伝子の変異体である。, SNCA遺伝子は、正常な脳細胞に豊富に存在するが、その機能は不明であるα-シヌクレインと呼ばれるタンパク質を作るための指示を提供する。 調査はSNCAの遺伝子の複数の共通の変化がヨーロッパの降下の人々の多系統萎縮の高められた危険と関連付けられることを提案します。 これらの変動が他の集団の疾患リスクにも影響するかどうかは不明である。 COQ2遺伝子は、補酵素Q2と呼ばれるタンパク質を作るための指示を提供します。, この酵素は、細胞内のエネルギー産生に重要な役割を果たすコエンザイムQ10と呼ばれる分子の産生に一歩を踏み出します。 COQ2遺伝子の変異は、日系人の多系統萎縮と関連しているが、この関連は他の集団では見つかっていない。 SNCAまたはCOQ2遺伝子の変化がどのようにして多系統萎縮を発症するリスクを高めるかは不明である。
研究者はまた、多系統萎縮のリスクに寄与する可能性のある環境要因を検討した。, 最初の調査は溶媒への露出が、ある特定のタイプのプラスチックまたは金属、および他の潜在的な毒素は条件と関連付けられるかもしれないことを しかし、これらの関連は確認されていない。
すべての場合において、多系統萎縮は、未知の理由により、脳および脊髄の多くの部分の細胞に蓄積する異常なα-シヌクレインタンパク質の塊 時間が経つにつれて、これらの塊(介在物として知られている)は、運動、バランスおよび調整、および自律神経機能を制御する神経系の部分の細胞を損, これらの領域における細胞の進行性の喪失は、多系統萎縮の主な特徴の根底にある。
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