Medical Subject Headings Used to Search the Biomedical Literature (Polski)

Abstrakt

baza danych MEDLINE (MEDLARS Online) National Library of Medicine była pierwszą bazą danych przeszukiwaną w całym kraju za pomocą sieci telekomunikacyjnych o wartości dodanej. Obecnie dostępna w World Wide Web bezpłatnie z National Library of Medicine i z wielu innych źródeł, jest najczęściej używaną bazą danych medycznych na świecie., MEDLINE jest unikalny, ponieważ każde odniesienie do literatury medycznej jest indeksowane w kontrolowanym słownictwie zwanym Medical Subject Headings (MeSH). Te nagłówki są kluczami, które odblokowują literaturę medyczną. MeSH mnoży użyteczność bazy danych MEDLINE i umożliwia przeszukiwanie literatury medycznej tak, jak to robimy dzisiaj. Artykuł ten upamiętnia 40. rocznicę wprowadzenia MeSH i pozdrawia niektórych dalekowzrocznych osób, które stworzyły i rozwinęły bazę danych MEDLINE.,

wpływ medlarów na świat Biblioteki Medycznej nie jest znany ze znanej metafory—Kamyk wpadł do stawu, odlewając koncentryczne okręgi, które docierają do wielu punktów na brzegu. Uderzenie nie jest kamykiem na pewno. To potężna skała. Fale, które to spowoduje, będą rosły i pluskały przez długi czas. nieszpułka lekarska jest wielkim przełomem bibliograficznym naszego pokolenia.- Ralph T. Esterquest

wypowiedziany przez Ralpha T. Esterquest na sympozjum w 1963,1 słowa te okazały się przekonujące, a także przejmujące., National Library of Medicine ' s Medline (medlars Online) database była pierwszą bazą danych przeszukiwaną w całym kraju za pomocą sieci telekomunikacyjnych o wartości dodanej. Obecnie dostępna w World Wide Web bezpłatnie z National Library of Medicine i z wielu innych źródeł, jest najczęściej używaną bazą danych medycznych na świecie.

Medline jest unikalny, ponieważ każde odniesienie do literatury medycznej jest indeksowane w kontrolowanym słownictwie zwanym Medical Subject Headings (MeSH). Te nagłówki są kluczami, które odblokowują literaturę medyczną., MeSH mnoży użyteczność bazy danych medline i umożliwia przeszukiwanie literatury medycznej tak, jak to robimy dzisiaj. Ten artykuł upamiętnia 40. rocznicę wprowadzenia MeSH i pozdrawia niektórych dalekowzrocznych osób, które stworzyły i rozwinęły bazę danych medline.

John Shaw Billings i pochodzenie Index Medicus

u zarania Wojny Secesyjnej student Medical College of Ohio potrzebował informacji na temat padaczki do pracy dyplomowej., Student, John Shaw Billings, spędził sześć miesięcy w bibliotekach w Cincinnati, Nowym Jorku i Filadelfii zbierając niezbędną literaturę. Literatura medyczna została następnie podzielona na tysiące list, bibliografii i indeksów; przeszukiwanie literatury medycznej było żmudne, o czym Billings nie zapomniał.2

Po ukończeniu studiów Billings wyróżnił się jako chirurg polowy w armii Unii., Po zakończeniu wojny dostał pracę jako asystent w gabinecie chirurga generalnego, gdzie przejął kolekcję książek, która powstała na półce za biurkiem Josepha Lovella, byłego chirurga generalnego. Lovell zmarł w 1836 roku, ale jego kolekcja nadal rosła, a kiedy Billings przybył liczył około 2000 tomów. W 1866 roku Gabinet chirurga generalnego wraz z kolekcją przeniósł się do Forda ' s Theatre,3 w Waszyngtonie, miejsca zamachu na prezydenta Lincolna.

Billings zgromadził kolekcję i do 1876 roku liczył 52 000 książek i broszur., Z czasem stała się największą biblioteką medyczną w kraju.4 odwołując się do swoich wcześniejszych doświadczeń w swojej bibliotece uniwersyteckiej, Billings postanowił zindeksować kolekcję według autora i tematu. W 1874 r. rozpoczął pracę indeksowania według tematyki artykułów, książek, tez, raportów i broszur, aby stworzyć obszerny indeks-katalog biblioteki chirurga ogólnego. Indeks-Katalog miał być ostatecznie opublikowany w kilku seriach obrotowych tomów alfabetycznych; nowe wpisy do anatomii otrzymywane tuż po wydaniu „A”miały duże opóźnienie w publikacji.,

W tamtych czasach wszystkie numery Index Medicus przez cały rok, w tym zarówno listy autorów, jak i tematów, łatwo mieszczą się w jednym tomie oprawionym; obecnie wymagają 16 oprawionych tomów. Pomysł, aby każdy artykuł w literaturze medycznej był indeksowany pod poruszanymi w nim tematami, doprowadziłby do opracowania siatki, z której dzisiaj korzystamy.,

Po odejściu Billingsa z Armii Stanów Zjednoczonych w 1895 roku został dyrektorem Nowojorskiej Biblioteki Publicznej, gdzie służył z wyróżnieniem przez kilka lat. Dyrektoriat Biblioteki gabinetu chirurga ogólnego i odpowiedzialność za Index Medicus były przekazywane z jednego starszego oficera medycznego do drugiego w kolejności czteroletnich etatów wojskowych. W 1927 roku Index Medicus został połączony z konkurencyjną bibliografią American Medical Association i przemianowany na Quarterly Cumulative Index Medicus.,

II wojna światowa przyniosła pilne zapotrzebowanie na aktualne informacje medyczne, a nowy dyrektor, Harold Wellington Jones, rozpoczął wydawanie cotygodniowego indeksu o nazwie Current List of Medical Literature. W 1943 r. Jones zorganizował przegląd Biblioteki przez profesjonalnych bibliotekarzy. Bardzo krytyczny raport z tego badania5 posłużyłby za plan istotnych ulepszeń w zbiorach, obsadzie, działalności i wyposażeniu biblioteki w ciągu najbliższych dwóch dekad., W odpowiedzi na jedno z zaleceń Jones opracował „zasady, które należy stosować przy doborze nagłówków tematycznych”, w oparciu o wytyczne pierwotnie sformułowane przez Billingsa.6

Frank Bradway Rogers i medyczne nagłówki tematyczne

w 1949 roku pułkownik Frank Bradway „Brad” Rogers został dyrektorem wojskowej Biblioteki Medycznej—wtedy nazwa tego, co było biblioteką biura chirurga generalnego armii. Jak każdy z jego poprzedników, Rogers był lekarzem. W przeciwieństwie do nich, został wysłany przez wojsko, aby uzyskać tytuł magistra bibliotekoznawstwa jako przygotowanie do pracy.,

pierwszy dyrektor, który został formalnie przeszkolony w bibliotekarstwie, Rogers wykorzystał zasady opracowane przez Jonesa i pracę wykonaną na podstawie umowy w Welch Medical Library Uniwersytetu Johnsa Hopkinsa, aby stworzyć w 1951 roku ustandaryzowaną listę pozycji tematycznych dla aktualnej listy literatury medycznej.7 w 1956 roku Kongres Stanów Zjednoczonych nadał Bibliotece medycznej Sił Zbrojnych (przemianowanej w 1952 roku) statutową nazwę National Library of Medicine i uczynił ją odrębną instytucją w ramach publicznej służby zdrowia Stanów Zjednoczonych., Później National Library of Medicine stał się częścią National Institutes of Health.

w 1960 roku Rogers kierował publikacją nowo odrodzonego miesięcznika Index Medicus wraz ze świeżo zmienioną i rozszerzoną listą znormalizowanych pozycji tematycznych. Lista-zwana nagłówkami tematyki medycznej lub siatką-składa się z terminów jedno – i wielowyrazowych, które są używane do indeksowania i katalogowania literatury medycznej. Artykuł upamiętnia 40. rocznicę powstania MeSH—kontrolowanego słownictwa, czyli tezaurusa, który umożliwia przeszukiwanie literatury biomedycznej w sposób, w jaki robimy to dzisiaj.,

poświęcony powszechnemu, terminowemu rozpowszechnianiu informacji medycznej, Rogers badał mechaniczne sposoby ułatwiające tworzenie miesięcznika „Medicus”. W 1958 roku wraz z Seymourem Taine ’em, ówczesnym dyrektorem National Library of Medicine' s indexing operation, zainicjował projekt mechanizacji indeksów, który wykorzystywał perforowaną taśmę papierową i karty perforowane, Maszyny do sortowania kart i szybki aparat fotograficzny. Projekt ten przyspieszył produkcję drukowanego indeksu Medicus, ale nie wspierał automatycznego pobierania.,

to wczesne doświadczenie z technikami zautomatyzowanymi i zainteresowanie Rogersa koncepcją indeksowania współrzędnych opracowaną przez Mortimera Taube' a 8 wpłynęło na strukturę i filozofię pierwszej edycji MeSH.

Katalogowanie tematyczne i indeksowanie periodyczne są w swoich głównych wymiarach identycznymi procesami, a do obu tych procesów należy stosować jeden organ. Nagłówki powinny być traktowane jako wskaźniki, a nie etykiety opisowe., Tematyczne podtytuły, jako substytuty nagłówków fraz, mogą być standaryzowane i powinny być, w przeciwieństwie do konkretnych głównych nagłówków, które ogólnie reprezentują szerokie pojęcia.9

główne nagłówki stały się bardziej szczegółowe w kolejnych wydaniach, ale MeSH nadal jest używany zarówno w katalogowaniu tematycznym, jak i indeksowaniu (nowatorskie pojęcie z 1960 roku), a standaryzowane podtytuły tematyczne pozostają kluczową cechą słownictwa MeSH.

z roku na rok indeks Medicus powiększa się. W 1960 roku roczna kumulacja liczyła trzy tomy., W 1999 roku pozycje autora wypełniło sześć tomów, a tematyka kolejnych dziesięć. Przeglądanie artykułów indeksowanych pod konkretną tematyką na przestrzeni lat wymaga konsultacji z wieloma obszernymi tomami.,

Index Medicus zapewnia sposób, choć niezręczny sposób, aby szukać artykułów napisanych przez konkretnego autora lub artykułów, które odnoszą się do konkretnego tematu, ale powiązane tomy nie zapewniają praktycznego sposobu, aby znaleźć artykuły, które omawiają dwa (lub więcej) tematy razem; można znaleźć artykuły o tymololu lub artykuły o zawale mięśnia sercowego, ale nie ma łatwego sposobu, aby skupić się na artykułach, które omawiają oba., Ponadto, pod każdym terminem MeSH, opublikowane tomy Index Medicus wymieniają tylko te artykuły, dla których termin ten został wyznaczony głównym tematem-jednym z (Zwykle dwóch do czterech) głównych tematów omawianych w artykule; Lista pozostałych artykułów spowodowałaby, że wydrukowane tomy będą zbyt grube i zbyt kosztowne.

MEDLARS

w 1960 roku, dzięki doświadczeniom z projektu mechanizacji indeksu i funduszom z Narodowego Instytutu Serca, Narodowa Biblioteka Medycyny rozpoczęła rozwój systemu analizy i wyszukiwania literatury medycznej (medlars)., W ramach tych wysiłków opracowano bazę danych siatek, a w 1963 r.pod kierownictwem Winifred Sewell wyprodukowano poprawioną i zrestrukturyzowaną siatkę.Od tego czasu 10 MeSH jest corocznie zmienianych i aktualizowanych. Wydanie z 1963 roku zawierało pierwszą wersję hierarchii siatki, czyli „struktur drzewnych” —wkrótce stało się potężną pomocą w automatycznym wyszukiwaniu. Od początku struktury drzewa MeSH były polihierarchiczne, co oznacza, że nagłówek główny może pojawić się w więcej niż jednej podkategorii., Na przykład gruźlica, wątroba pojawia się w drzewie chorób zakaźnych pod gruźlicą, a także w drzewie chorób układu pokarmowego pod chorobami wątroby.

w 1964 roku Biblioteka wprowadziła medlary—które przechowywały odniesienia bibliograficzne w skomputeryzowanej, możliwej do przeszukiwania bazie danych i wykonywały skomputeryzowane fototypowanie dla Index Medicus i innych, bardziej wyspecjalizowanych bibliografii. Począwszy od 1965 roku, wyszukiwania mogą być przekazywane do National Library of Medicine lub do jednego ze zdecentralizowanych centrów przetwarzania, które zostały utworzone w Stanach Zjednoczonych i za granicą., Specjalnie przeszkoleni bibliotekarze, którzy uczestniczyli w kursach trwających aż 3 miesiące, następnie formułowali każde wyszukiwanie i przesyłali je do centrum Wyszukiwania medlars, gdzie perforowane karty były podawane do komputera, a powstały Wydruk był wysyłany z powrotem pocztą paczkową. W Stanach Zjednoczonych czas realizacji zamówienia wynosił średnio od 4 do 6 tygodni.9

Wyszukiwanie offline w trybie wsadowym opóźniło satysfakcję; nierzadko wyniki wyszukiwania wróciły po tym, jak pytanie kliniczne nie było już istotne. Ponadto trudno było przewidzieć, ile trafień przyniesie konkretne wyszukiwanie., Aby pomóc w obejściu tego problemu, medlars zezwolił na trzy wyszukiwania, z których każda jest przetwarzana w stosunku do poprzednich. Tak więc doświadczony poszukiwacz może dążyć do przywołania z pierwszym stwierdzeniem, do specyficzności z trzecim i do akceptowalnej równowagi z drugim. Mimo to, aby rozszerzyć wyszukiwanie, które przyniosło zbyt mało trafień lub skupić się na jednym, które przyniosło zbyt wiele wymaganego ponownego przesłania i dalszego opóźnienia; wyszukiwanie musiało być wykonane online.,

w grudniu 1968 roku, finansowany przez National Library of Medicine, pierwszy w czasie rzeczywistym, internetowy system wyszukiwania bibliograficznego został zainaugurowany w SUNY Biomedical Communication Network, z siedzibą w SUNY Upstate Medical Center Library w Syracuse, Nowy Jork.9 dziewięć bibliotek medycznych używało terminali teletypewriter do wyszukiwania 90 000 odniesień pobranych z bazy danych medlars. Wyszukiwania mogły być wykonywane dla nazwisk autorów lub nagłówków medycznych tematów, i mogą być ograniczone przez datę lub język; nie było przepisu na wyszukiwanie słów tekstowych w tytule lub abstrakcie., Wyszukiwania były wysyłane online, ale dopóki wyniki nie zostały wydrukowane w trybie offline i wysłane pocztą, wyszukiwarka nie wiedziała, ile trafień przyniesie Wyszukiwanie, ani czy były one na celu. Mimo to dziewięć bibliotek dokonało więcej przeszukań za pośrednictwem SUNY niż reszta kraju dokonała za pośrednictwem medlars.10

w 1970 roku National Library of Medicus, która otrzymała wnioski o pożyczkę międzybiblioteczną za pośrednictwem Teletypewriter Exchange, lub TWX, eksperymentowała z ogólnopolskim dostępem online do około 100 czasopism indeksowanych dla skróconego indeksu Medicus, lub AIM.,11 krótkotrwały, ale popularny, projekt o nazwie AIM-TWX, dostarczył dalszych dowodów, że ludzie chcieli szukać w Internecie.

MEDLINE

w 1971 roku Narodowa Biblioteka Medycyny wprowadziła medlars Online, lub medline, na bardziej zaawansowane oprogramowanie do pobierania i udostępniła je za pośrednictwem sieci telekomunikacyjnych o wartości dodanej. Oprogramowanie to, nazwane Elhill, pozwoliło wyszkolonym poszukiwaczom-przede wszystkim bibliotekarzom-wyszukiwać słowa w tytule, a także stałe pola, takie jak nagłówek tematu medycznego, tytuł czasopisma, rok publikacji i tym podobne., Elhill został nazwany na cześć (Josepha) Listera Hilla, senatora z Alabamy i silnego orędownika opieki zdrowotnej, dla którego Lister Hill National Center for Biomedical Communications, które pomógł stworzyć, również zostało nazwane.

zanim zezwolono im na korzystanie z oprogramowania Elhill do przeszukiwania bazy danych medline, poszukiwacze musieli odbyć dwutygodniowy kurs wyszukiwania online i korzystania z MeSH., Pracownicy badawczy i klinicyści omówili swoje zapotrzebowanie na informacje z jednym z tych specjalnie wyszkolonych poszukiwaczy, którzy przetłumaczyli żądanie na odpowiednią strategię wyszukiwania i przeprowadzili wyszukiwanie. Było to znane jako „wyszukiwanie pośredniczące”; z rzadkimi wyjątkami „wyszukiwanie użytkownika końcowego” nie istniało.

w pierwszych dniach medline bibliotekarze Zwykle przygotowywali każde wyszukiwanie przed wejściem do Internetu. Czas połączenia był zbyt drogi, aby go zmarnować, a początkowy system wymagał od Wyszukiwarki wpisywania każdego terminu w dokładnie poprawnym formacie., Drukowane tomy, takie jak Permutowana Siatka, były używane do kierowania poszukiwacza do nieznanych terminów siatek. Poszukiwacze musieli wiedzieć (lub spojrzeć w górę), które pojęcia siatki są liczby pojedynczej (oko, ręka i Stopa), a które liczby mnogiej (palce i palce u nóg). Musieli wiedzieć, kiedy rzeczownik poprzedzał przymiotnik (dieta, redukcja) i kiedy przymiotnik poprzedzał rzeczownik( Dieta cukrzycowa), a także kiedy zastosować podtytuł do głównego nagłówka (nadciśnienie tętnicze/dieta terapia) i kiedy używać Boolean i z oddzielnym nagłówkiem tematu medycznego (nadciśnienie tętnicze i Dieta cukrzycowa)., Musieli używać specjalnych skrótów dla nazw czasopism (New Engl J Med dla New England Journal of Medicine, ale JAMA dla Journal of the American Medical Association) i musieli wiedzieć, że nazwiska autorów były przechowywane w formie Smith JA.

gdy wyszukiwanie słów tekstowych i więcej mesh crossreferences stało się dostępne online, a czas połączenia stał się tańszy, Wyszukiwarki zaczęły korzystać z natychmiastowych informacji zwrotnych z systemu, aby przygotować i udoskonalić swoje wyszukiwania., Szukający, który nie był pewien terminu siatkowego, mógł zamiast szukać go w ogromnej książce, wyszukiwać według tytułu lub abstrakcyjnych słów, znaleźć kilka odniesień do celu i zobaczyć, jak były one indeksowane. Zamiast spędzać czas poszukiwacz przygotować wyszukiwanie w formie, która byłaby akceptowalna dla komputera—zamiast poszukiwacz pracuje dla komputera—komputer zaczął pracować dla poszukiwacza.,

produkcja bazy danych medline

czasopisma wybrane przez National Library of Medicine do indeksowania są wysyłane do zespołu specjalnie przeszkolonych indeksatorów, którzy analizują każdy artykuł i przypisują mu nagłówki z zakresu medycyny. Przyporządkowują one średnio od ośmiu do dziesięciu nagłówków do każdego artykułu. Jak wcześniej wspomniano, średnio od dwóch do czterech z nich są określane jako „główny nacisk” artykułu. Te nagłówki są głównymi tematami omawianymi w artykule i są nagłówkami, pod którymi artykuł pojawia się w drukowanym indeksie Medicus., Pozostałe nagłówki odnoszą się do tematów, które są omawiane, ale nie są głównymi punktami.

większość pozycji można również przypisać podpozycjom; w ten sposób artykuł omawiający skutki uboczne Aldometu można zindeksować pod główną pozycją Methyldopa z podpozycją niepożądane skutki. Indekser bada również każdy artykuł pod kątem innych typów deskryptorów, takich jak typy publikacji (artykuł historyczny, Recenzja, list do Redakcji, wytyczne itp.) i znaczniki kontrolne (ludzkie, zwierzęce, męskie, żeńskie itp.).,

indeksator używa najbardziej konkretnego terminu dostępnego w hierarchicznej strukturze drzewa siatki. Tak więc artykuł, który omawia anoreksję i bulimię, ale żaden inny rodzaj zaburzeń jedzenia, będzie indeksowany pod anoreksją i pod bulimią, ale nie Pod zaburzeniami jedzenia, zaburzeniami psychicznymi lub psychiatrią., Ponieważ siatka jest zorganizowana hierarchicznie, oprogramowanie pozwala na wyszukiwanie ograniczone do artykułów indeksowanych Pod ogólnym terminem zaburzenia psychiczne, jak również wyszukiwania, które „eksplodują” zaburzenia psychiczne, aby uwzględnić wszystkie artykuły indeksowane z dowolnymi bardziej szczegółowymi terminami siatki, które pojawiają się pod nim w hierarchii siatki. Pod zaburzeniami psychicznymi znajdujemy Zaburzenia lękowe, zaburzenia osobowości, Zaburzenia jedzenia i tym podobne, a pod zaburzeniami jedzenia znajdujemy bulimię, anoreksję, Hiperfagię i tym podobne., Eksplozja zaburzeń psychicznych odzyskałaby odniesienia indeksowane pod którymkolwiek z tych tematów i nie tylko. W niektórych sekcjach MeSH każdy termin potomny jest podzbiorem jego rodzica, podczas gdy w innych sekcjach grupy są bardziej pragmatyczne niż logiczne—to znaczy przydatne do pobierania, gdy termin rodzica jest „eksplodowany”.”

pierwotnie praktyka indeksowania Pod jak najbardziej specyficznym terminem służyła ograniczeniu liczby wpisów wymienionych pod jednym terminem w drukowanych tomach Index Medicus.11 w ostatnim czasie umożliwiło to ograniczenie poszukiwań do określonego obszaru praktyki medycznej lub badań naukowych., Na przykład w 1988 roku termin HIV został dodany do słownika MeSH. Rok później, aby uwzględnić badania nad podgatunkami wirusa HIV, dodano określenia HIV1 i HIV2. Dodanie tych bardziej szczegółowych terminów pozwala klinicystom lub badaczom na dalsze ukierunkowanie wyszukiwania.

w ciągu ostatnich 40 lat liczba głównych pozycji siatki wzrosła z 4400 do blisko 20 000. Znacznie rozbudowano również strukturę odsyłaczy. Obecnie istnieje ponad 120 000 odsyłaczy lub „terminów wejściowych”, w tym zmian kolejności słów (np.,, Zaburzenia psychiczne, Organiczne zobacz organiczne zaburzenia psychiczne), które pomagają wskazywać użytkownikom własne słowa Na hasła.

jednym z problemów z wyszukiwaniem według terminów MeSH zawsze było to, że artykuły indeksowane przed wprowadzeniem terminu nie są indeksowane pod tym terminem. Rzeczywiście, oryginalny opis—przełomowy artykuł—o każdym nowym temacie prawie nigdy nie jest indeksowany pod tym tematem., Tak więc, kiedy Gruntzig, Senning i Siegenthaler opisali przezskórną transluminalną angioplastykę wieńcową w New England Journal of Medicine w lipcu 1979,12 indeksujący w National Library of Medicine nie mieli możliwości wiedzieć, że ta nowa technika stanie się wystarczająco ważna, aby uzasadnić nowy temat Medyczny. Ten artykuł (jak również kilka krótszych, wcześniejszych opisów) był indeksowany pod takimi pojęciami, jak angiografia, cewnikowanie, cewnikowanie serca i naczynia wieńcowe., Wraz z publikacją kolejnych artykułów znaczenie techniki stało się jaśniejsze, a w 1981 roku wprowadzono tytuł Medyczny angioplastyka, balon, a następnie w 1989 roku termin angioplastyka, Transluminal, przezskórna choroba wieńcowa.

aby uniknąć brakujących odniesień indeksowanych przed wprowadzeniem terminu MeSH, wyszukiwacze mogą używać słów tekstowych w tytułach i abstraktach do wyszukiwania cytatów indeksowanych w poprzednich latach. Jeden z programów13 używanych do przeszukiwania bazy danych medline wykorzystuje algorytmy, które próbują przeanalizować znaczenie tytułu i abstraktu., Inne Interfejsy medline przeszukują każdy termin tematyczny zarówno jako termin MeSH, jak i słowa tekstowe.

dokładność bazy danych MEDLINE

w bazie danych medline słowa tekstowe i nazwiska autorów są czasami błędnie pisane. Niektóre błędy pisowni pochodzą z drukowanego rękopisu. Użytkownicy końcowi również błędnie zapisują wpisy. Jeśli użytkownik końcowy i baza danych medline błędnie zapisują słowo tytułowe w ten sam sposób i jeśli oprogramowanie wyszukiwania automatycznie mapuje (błędnie) słowa tytułowe do MeSH, użytkownik, który błędnie wpisuje wpis, może nadal znaleźć odpowiedni termin MeSH i uzyskać dobry wynik.,13

ponieważ wyszukiwanie za pomocą siatki jest tak ważne, powstaje pytanie, jak dokładnie stosuje się terminy siatki. Funk i Reid zbadali bazę danych medline pod kątem spójności indeksacji, 14, ale według naszej wiedzy nie ma opublikowanych badań dokładności. Z drugiej strony, jeden z nas dokonał wyszukiwania, aby spróbować „złapać” indeksujących. Wiele z tych poszukiwań ujawniło wyraźne pominięcia, ale analiza oryginalnego artykułu ujawniła, z rzadkim wyjątkiem, dlaczego został on indeksowany w takim stanie, w jakim był., Szczególnie w obszarze, który jest najważniejszy dla wyszukiwania—przypisywanie terminów MeSH—baza danych medline wydaje się być niezwykle dokładna.

MeSH, medline, World Wide Web i wyszukiwarka pełnotekstowa

w ostatnich latach, zainspirowane częściowo potrzebą znalezienia dokumentów w Internecie, Wyszukiwarki pełnotekstowe stały się popularne. Podczas korzystania z wyszukiwarki pełnotekstowej użytkownik wpisuje zapytanie w wyznaczonym obszarze i kliknie GO lub SUBMIT, aby pobrać wynik., Wyszukiwarki pełnotekstowe różnią się tym, jak wybierają i prezentują „trafienia”, ale większość stara się najpierw przedstawić te dokumenty, które zawierają jak najwięcej słów zapytania tak często, jak to możliwe. Tak więc „hit”, który zawiera wszystkie słowa zapytania wiele razy i blisko siebie, zostanie przedstawiony przed „hit”, który zawiera tylko jedno słowo zapytania raz. Często algorytmy ignorują przyimki i inne „słowa stop” i nadają większą wagę terminom rzadkim, terminom, które pojawiają się blisko początku dokumentu i terminom, które pojawiają się w tekście w tej samej kolejności, w jakiej pojawiają się w zapytaniu.,

Wyszukiwarki pełnotekstowe rutynowo zajmują się wariantami leksykalnymi, takimi jak znieczulenie i znieczulenie lub kolor i kolor, a także z formami liczby mnogiej. Do pewnego stopnia zajmują się synonimami. Ponadto często zapewniają zaawansowane funkcje, które dają użytkownikowi pewną kontrolę nad strategią wyszukiwania, takie jak możliwość ograniczenia wyszukiwania do elementów, w których pojawiają się wszystkie słowa zapytania lub wymagania, aby niektóre słowa były obok siebie lub blisko siebie., Ponadto zaawansowane systemy wyszukiwania pełnotekstowego wykorzystują ustrukturyzowane informacje o pojęciach i ich relacjach w kontrolowanych słownikach. Unified Medical Language System (UMLS) Metathesaurus, 15, który zapewnia dostęp do wielu kontrolowanych słowników, w tym MeSH, jest używany w aplikacjach przetwarzania języka naturalnego i wyszukiwania pełnotekstowego, w tym wielu wyszukiwarkach internetowych.

techniki wyszukiwania pełnotekstowego umożliwiają wyszukiwanie różnych zbiorów informacji, których największym i najlepszym przykładem jest Internet., Jeszcze-lepsze wyszukiwanie wynikałoby, gdyby materiał w Internecie był bardziej jednolicie zorganizowany i oznaczony oraz gdyby Wyszukiwarki lepiej wykorzystywały strukturę i tagowanie. Dążenie do lepszego wyszukiwania informacji w Internecie wyjaśnia niektóre z obecnych zainteresowań standardami „metadanych” i językami znaczników, takimi jak SGML i XML.

Sieć jest duża, przeglądarki internetowe są powszechne, a Wyszukiwarki pełnotekstowe są popularne; w rezultacie użytkownicy są zaznajomieni z wpisywaniem w wyznaczonym obszarze, naciśnięciem GO i pobieraniem wyniku., Możliwość wyszukiwania medline z tym samym wyglądem i odczuciem, co reszta sieci ma wiele zalet. Autorzy pragną jednak zachować ostrożność. W przeciwieństwie do większości innych elementów w sieci, dokumenty w bazie danych medline są indeksowane jednolicie, hierarchicznie i dokładnie. Wyszukiwanie za pomocą terminów MeSH jest często głównym czynnikiem przyczyniającym się do kompletności i precyzji wyszukiwania medline. Sposób, w jaki wyszukiwarka pełnotekstowa mapuje zapytanie użytkownika do siatki, ma podstawowe ograniczenie, a mianowicie nie prowadzi dialogu z użytkownikiem w celu rozwiązania niejasności lub zaoferowania alternatyw., Tak więc użytkownik, który błędnie pisze termin MeSH, który nie wie, że istnieje bardziej precyzyjny termin MeSH, który wyraża pojęcie w słowach, które mapują do kilku różnych terminów MeSH, lub który używa słów, których wyszukiwarka pełnotekstowa nie może mapować do MeSH, prawdopodobnie uzyska gorszy wynik wyszukiwania.

dzisiejsze Wyszukiwarki pełnotekstowe nie tylko ograniczają możliwości mapowania zapytań użytkowników do siatki, ale w przypadku medline nie prezentują trafień w kolejności malejącej użyteczności., Gdy wyszukiwanie generuje dużą liczbę trafień, których nie można zmniejszyć, uważamy, że ważne jest, aby oprogramowanie prezentowało najpierw pozycje w najlepszych czasopismach medycznych. Artykuł opublikowany w New England Journal of Medicine jest o wiele bardziej przydatny niż artykuł, który spełnia te same kryteria wyszukiwania, ale jest opublikowany w języku innym niż Angielski, w czasopiśmie priority 3 i który nie ma streszczenia online.

podsumowanie

artykuł koncentruje się na siatce w kontekście rozwoju Index Medicus i medline, z którymi Siatka jest nierozerwalnie związana., Z pewnością MeSH miał swój główny wpływ na Medyczne wyszukiwanie bibliograficzne. Jednak, jako pierwszy duży tezaurus zaprojektowany do użytku w zautomatyzowanym systemie, MeSH jest również punktem zwrotnym w reprezentacji słownictwa medycznego i danych koncepcyjnych w formie do odczytu maszynowego. W latach 80., kiedy rozpoczął się projekt UMLS, 15 wielu badaczy informatyki medycznej zaczęło dokładnie badać cechy słowników i klasyfikacji medycznych nadających się do odczytu maszynowego., W tym czasie MeSH stał zasadniczo sam jako przykład słownictwa z wyraźnie oznaczonym formatem bazy danych, bezkontekstowymi identyfikatorami, polihierarchią, rozbudowaną strukturą odsyłaczy, definicjami tekstu i niezawodnym cyklem aktualizacji. Obecnie wiele z tych cech jest postrzeganych jako krytyczne wymagania dla kontrolowanych słowników, które będą używane w systemach klinicznych.16

na arenie bibliograficznej uważamy, że poważne wyszukiwanie w medline wymaga umiejętności tworzenia list odniesień według terminu MeSH, słowa tytułowego, słowa abstrakcyjnego, autora, roku, instytucji, źródła i tym podobnych., Wymaga to możliwości łączenia tych list z Boolean AND, OR, I okazjonalnie I NIE, oraz kierowania się liczbą trafień po drodze. Użytkownicy końcowi często potrzebują pomocy w znalezieniu nagłówków i podtytułów medycznych, których nie znają lub nie potrafią przeliterować, pomocy w nawigacji w hierarchii MeSH oraz pomocy z nazwiskami autorów i czasopism.

Siatka jest tak potężna, że z kilkoma wyjątkami każde wyszukiwanie, które można wykonać za pomocą siatki, powinno być wykonane za jej pomocą., Ponieważ wyszukiwarki pełnotekstowe są obecnie ograniczone w możliwości mapowania zapytań użytkownika do nagłówków medycznych, istnieje ryzyko, że siatka zostanie usunięta. Mamy nadzieję, że tak się nie stanie. Niech pierwsze 40 lat będzie tylko początkiem.

autorzy dziękują Pani Betsy Humphreys, Pani Lucretii McClure i innym za ich wiele przemyślanych sugestii.