분자의 달
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DNA helicase pries 떨어져 두 가닥 DNA 의 두 번 나선에 의해 구동 ATP
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우리의 유전 정보는 DNA 의 이중 나선 안에 안전하게 잠겨 있습니다. 에서 사용하기 위해 이 정보를 나선 해제해야 합 노출시키지 할 수 있도록,폴 액세스 구축을 보완 DNA 또는 RNA 의 가닥이다. DNA 의 풀기는 생각보다 까다 롭습니다. 기지 사이의 상호 작용은 매우 강하고 그 중 많은 것들이 있기 때문에 가닥을 분리하는 데 상당한 에너지가 필요합니다. 이것은 DNA helicases 의 일입니다:그들은 DNA 이중 나선에서 두 가닥을 떼어 낸 효소입니다.,
복제 Helicases
pdb 항목 4esv 에서 여기에 표시된 helicase 는 박테리아 게놈의 복제 동안 DNA 가닥을 분리합니다. 염색체는 원이고 복제는 원의 한 지점(“원점”이라고 함)에서 시작하여 양방향으로 진행되어 반대쪽에서 마무리됩니다. Helicase 는 DNA 의 단일 가닥 부분(여기에 오렌지색으로 표시됨)을 둘러싸고 가닥을 따라 길을 가면서 이중 나선을 분리합니다. ATP(빨간색으로 표시)를 사용하여이 동작에 전원을 공급합니다.,
주변 DNA
일차 DNA helicases 는 회원들의 큰 클래스는 단백질의 엔진을 사용하는 ATP 를 밀어 단백질 또는 핵산의 반지를 통해 단백질 subunits. 이 효소는 일반적으로 두 가지로 카테고리:세균 것과 유사하 RecA,단백질에 관여하는 유전자 재조합,그리고 우리의 일차 helicases AAA+ATPases 와 유사한 AAA+프로테아제. 두 경우 모두 복합체는 DNA 의 단일 가닥을 둘러싸는 서브 유닛의 고리를 형성합니다., 의 일차 helicase 여기에 표시로 구성되어 여섯 개의 동일한 하위 단위는 형태로 록 와셔 모양의 복잡한을 가진 여섯 소 단위 다음에 나선의 DNA 안에 갇혀.
융 DNA
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두 개의 단백질을 돕기 위해 세포 증식하는 helicases 에서 얻는 전체 과정을 시작합니다., 개시제로 알려진 첫 번째는 복제의 기원에 결합하여 헬리 케이즈를 적절한 위치에 모집합니다. 여기에 표시된 개시제 단백질 인 DnaA(PDB entry3r8f)는 또한 DNA 가닥의 초기 분리를 촉매합니다. 그것은 서브 유닛의 긴 헬리컬 어셈블리를 형성하고 두 가지 다른 작업을 수행하는 것으로 생각됩니다. 처음에는,DNA 두 번 나선 주위를 감싸는,외부에 형성 superhelical 구조는 다음을 특별한 시퀀스에서는 원산지에서 풍부에 기초 쌍으며,이에 따라 더 약하게 결합보다 가장 DNA 영역입니다., 그런 다음 DnaA 는 AT-rich 영역에 결합하여이 구조에서 볼 수 있듯이 가닥 중 하나를 포착하고 확장하여 이중 나선을 녹일 수 있도록 도와줍니다.
탐험 구조
- 이미지
- JSmol1
두 번째 단백질,helicase 로더 지원자 및 보호자의 일차 DNA helicase 에 단일드도 있습니다., 구조 표시기(PDB 항목 4m4w)포함되어 있 DNA helicase(블루),a helicase 로더(마젠타)에 작은 도메인에서 primase(녹색),효소를 구축 할 것입니다 짧은 RNA 프라이머를 가져오는 복제를 시작했다. 이 낮은 해상도의 구조를 사용하여 해결 원자-해상 구조물의 개별 구성 요소 및 보시켜주는 격차에서의 반지 helicase subunits 될 수 있는 사이트의 입력 단 하나의 가닥 DNA. 이 구조를 더 자세히 탐색하려면 대화 형 Jmol 에 대한 이미지를 클릭하십시오.,
항목을 추가 논의를 위해
- 여러 가지 다른 구조의 helicases 에 바인딩하는 단일 가닥 DNA 에서 사용할 수 있 PDB 포함한 세균의 DNA helicase 담당자 역할을 하는 이합체(항목 1uaa).
- DnaA 는 이중 가닥 DNA 에 결합하여 DnaA 어셈블리의 외부를 감싸는 도메인을 가지고 있습니다. 이중 가닥 DNA 에 결합 된이 도메인의 구조는 PDB 엔트리 1j1v 에서 이용 가능하다.,
- helicase loader DnaC 의 구조는 DnaA 의 구조와 현저하게 유사하여 서브 유닛의 유사한 나선을 형성합니다. 사용할 수 있습니다”비교구조”도구를 겹치게 이 두 구조를 PDB 항목 3ecc 및 3r8f.
관련 PDB-101 자원
- 에 대해 더 많은 DNA Helicase
- 찾아보기는 단백질 합성
- 4m4w:B.Liu,W.K.Eliason&A.T., Steitz(2013)helicase-helicase 로더 복합체의 구조는 박테리아 primosome 조립의 메커니즘에 대한 통찰력을 보여준다. 자연 통신 4:2495.
- 4esv:O.Itsathitphaisarn,R.A.Wing,W.K.Eliason,J. 왕&T.Steitz(2012)hexameric helicase DnaB 채택하고 비평면 구조 동안 전좌. 세포 151,267-277.
- P.Soultanas(2012)복제 기원에서 링 헬리 케이스의 로딩 메커니즘. 분자 미생물학 84,6-16.
- 3r8f:K.E.Duderstadt,K.Chuang&J.M., Berger(2011)박테리아 개시제에 의한 DNA 연신은 복제 기원 개방을 촉진한다. 자연 478,209-213.
December2013,데이비드 Goodsell
doi:10.2210/rcsb_pdb/mom_2013_12
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