ADN-ul După

ADN-ul după pries în afară de cele două fire într-un dublu helix de ADN, alimentat de ATP

ADN-ul după trăgând de un singur fir de ADN (portocaliu) prin centru.,

Descărcați imagini TIFF de înaltă calitate

informațiile noastre genetice sunt blocate în siguranță în interiorul dublei helix a ADN-ului. Pentru a utiliza aceste informații, helixul trebuie să fie desfăcut pentru a expune bazele, permițând accesul polimerazelor pentru a construi fire complementare de ADN sau ARN. Dezlegarea ADN-ului este mai complicată decât te-ai putea aștepta. Interacțiunea dintre baze este destul de puternică și există multe, multe dintre ele, deci este nevoie de energie apreciabilă pentru a separa firele. Aceasta este treaba helicazelor ADN: sunt enzime care desprind cele două fire într-o dublă helix ADN.,helicazele Replicative helicazele prezentate aici , de la intrarea PDB 4esv, separă firele ADN în timpul replicării unui genom bacterian. Cromozomul este un cerc și replicarea începe într-un punct al cercului (numit „origine”) și se desfășoară în ambele direcții, terminând pe partea opusă. Helicaza înconjoară o porțiune monocatenară a ADN-ului (prezentată aici în portocaliu) și își croiește drumul de-a lungul firului, separând dubla helix în timp ce merge. Acesta utilizează ATP (prezentat în roșu) pentru a alimenta această mișcare.,ADN-ul replicativ helicazele sunt membre ale unei clase mari de motoare proteice care utilizează ATP pentru a împinge proteinele sau acizii nucleici printr-un inel de subunități proteice. Aceste enzime se încadrează în general în două categorii: cele bacteriene sunt similare cu RecA, o proteină implicată în recombinare genetică, și osteoblasti helicases sunt AAA+ ATPases, similar cu AAA+ proteaze. În ambele cazuri, complexul formează un inel de subunități care înconjoară un singur fir de ADN., Helicaza replicativă prezentată aici este compusă din șase subunități identice care formează un complex în formă de lockwasher, cu cele șase subunități urmând helixul ADN-ului prins în interior.

Topire ADN-ul

DnaA proteine înfășurat în jurul unui singur fir de ADN (portocaliu).două proteine ajută helicazele replicative celulare să înceapă întregul proces., Primul, cunoscut ca inițiator, se leagă de originea replicării și recrutează helicaza în locația corespunzătoare. ADN-ul, proteina inițiatoare prezentată aici (PDB entry 3r8f ), catalizează, de asemenea, separarea inițială a firelor ADN. Formează un ansamblu elicoidal lung de subunități și se crede că îndeplinește două sarcini diferite. Inițial, helixul dublu ADN se înfășoară în exterior, formând o structură superhelică lângă o secvență specială de origine care este bogată în perechi de baze AT și, astfel, este mai slab legată decât majoritatea regiunilor ADN., Apoi, DnaA se leagă de regiunea bogată în AT, ajutând la topirea dublei helix prin captarea și extinderea uneia dintre fire, așa cum se vede în această structură.

Explorarea Structura

• Imagine
• JSmol 1

Un al doilea proteine, o după încărcător, asistă inițiatorul și însoțitori de replicație a ADN după pe un singur fir., Structura prezentată aici (PPB intrare 4m4w ) include ADN după (albastru), după loader (magenta) și un mic domeniu din primase (verde), enzima care va construi scurt de ARN primer care devine replicare a început. Această structură cu rezoluție scăzută a fost rezolvată folosind structuri de rezoluție atomică ale componentelor individuale și prezintă un decalaj evocator în inelul subunităților helicase care pot fi site-ul de intrare a unui singur fir de ADN. Pentru a explora mai detaliat această structură, faceți clic pe imagine pentru un Jmol interactiv.,

Subiecte pentru Discuții Ulterioare

1. mai Multe alte structuri de helicases legat de singur-stranded ADN-ul sunt disponibile în PPB, inclusiv ADN-ul bacterian după Reprezentant, care acționează ca un dimer (intrare 1uaa).
2. DnaA are un domeniu care se leagă de ADN-ul dublu catenar, înfășurându-l în jurul exteriorului ansamblului DnaA. O structură a acestui domeniu legată de ADN dublu catenar este disponibilă în intrarea PPB 1j1v.,
3. structura încărcătorului Helicase DnaC este remarcabil de similară cu structura DnaA, formând o helix similară a subunităților. Puteți utiliza „Compara Structuri” instrument de a suprapune aceste două structuri, în PPB intrări 3ecc și 3r8f.

Legate PPB-101 Resurse

• Mai multe despre ADN-ul După
• Browse Sinteza de Proteine

1. 4m4w: B. Liu, W. K. Eliason & T. A., Steitz (2013) structura unui complex helicase-helicase loader dezvăluie informații despre mecanismul de asamblare a primozomilor bacterieni. Nature Communications 4: 2495.
2. 4esv: O. Itsathitphaisarn, R. A. Aripa, W. K. Eliason, J. Wang & T. Steitz (2012) hexameric după DnaB adoptă o nonplanar conformație în translocație. Celula 151, 267-277.
3. P. Soultanas (2012) mecanisme de încărcare a helicazelor inelare la origini de replicare. Microbiologie Moleculară 84, 6-16.
4. 3r8f: K. E. Duderstadt, K. Chuang & J. M., Berger (2011) ADN-ul care se întinde de către inițiatorii bacterieni promovează deschiderea originii replicării. Natură 478, 209-213.

decembrie 2013, David Goodsell

doi:10.2210/rcsb_pdb/mom_2013_12

Despre Molecula de Luna

Cea de-RCSB PPB Moleculă de Luna de David S. Goodsell (La Scripps Research Institute și RCSB PPB) prezintă scurte conturi pe anumite molecule de Proteine Banca de Date., Fiecare tranșă include o introducere în structura și funcția moleculei, o discuție despre relevanța moleculei pentru sănătatea și bunăstarea umană și sugestii pentru modul în care vizitatorii ar putea vizualiza aceste structuri și accesa detalii suplimentare. Mai mult