| kategorian |
mukaan päivämäärän |
|
| mukaan |
|
|
|
div id=”32019337c7″ >
DNA helicase Pries apart the two strands in a DNA Double Helix, powered by ATP
DNA-helikaasi vetää yhden DNA-juosteen (oranssin) keskustan läpi.,
Lataa korkealaatuinen TIFF-kuva
geneettiset tietomme on turvallisesti lukittu DNA: n kaksoiskierteen sisään. Jotta voit käyttää tätä tietoa, helix on purettiin paljastaa perustan, jonka avulla polymeraasien käyttää rakentaa täydentäviä DNA-tai RNA-säikeet. DNA: n purkaminen on hankalampaa kuin voisi odottaa. Emästen välinen vuorovaikutus on melko voimakasta ja niitä on paljon, joten säikeiden erottaminen vaatii tuntuvaa energiaa. Tämä on DNA-helikaasien tehtävä: ne ovat entsyymejä, jotka hajottavat DNA: n kaksoiskierteessä olevat kaksi juostetta.,
Replicative helicases avulla
helicase kuvassa, mistä ATE merkintä 4esv , erottaa DNA-säikeet aikana replikointi bakteeri genomin. Kromosomi on ympyrä ja replikaatio alkaa ympyrän yhdestä pisteestä (jota kutsutaan ”originiksi”) ja etenee molempiin suuntiin, sijoittuen vastakkaiselle puolelle. Helikaasi ympäröi yksijuosteisen osan DNA: sta (näkyy täällä oranssina) ja tuumaa matkaansa juostetta pitkin erottaen kaksoiskierteen sen kulkiessa. Se käyttää ATP (näkyy punaisella) valtaa tämän liikkeen.,
Ympäröivän DNA:
Replicative DNA helicases avulla on jäseniä suuren luokan proteiinia moottorit, jotka käyttävät ATP työntää proteiineja tai nukleiinihappoja läpi rengas proteiini alayksikön. Näitä entsyymejä on yleensä jakaa kahteen ryhmään: bakteeri-ne ovat samankaltaisia kuin RecA, proteiini mukana geneettinen rekombinaatio, ja meidän replicative helicases avulla on AAA+ ATPases, samanlainen AAA+ proteaasien. Kummassakin tapauksessa kompleksi muodostaa alayksiköiden renkaan, joka ympäröi DNA: n yksittäistä juostetta., Se replicative helicase kuvassa koostuu kuudesta identtisestä alayksiköstä, jotka muodostavat jousilevy-muotoinen monimutkainen, jossa kuusi alayksikön seuraavat helix DNA loukkuun.
Sulamis-DNA:
DnaA proteiineja kiedottu yhden lohkon DNA: n (oranssi).
Lataa laadukas TIFF-kuva
Kaksi proteiineja, auttaa solujen replicative helicases avulla saamaan koko prosessi alkoi., Ensimmäinen, joka tunnetaan aloitteentekijänä, sitoutuu replikaation alkuperään ja värvää helikaasin oikeaan paikkaan. DNAa, tässä esitetty initiaattoriproteiini (PDB-merkintä 3r8f), katalysoi myös DNA-säikeiden ensimmäistä erottelua. Se muodostaa alayksiköiden pitkän kierteisen kokoonpanon ja sen arvellaan suorittavan kaksi eri tehtävää. Aluksi DNA-kaksoiskierre kiertyy ulkopuolella, muodostaen superhelical rakenne seuraava erityinen sekvenssi, alkuperä, joka on runsaasti TÄLLÄ-base paria, ja siten on enemmän heikosti sidottu kuin useimmat DNA-alueilla., Sitten, DnaA sitoutuu AT-rikas alue, auttaa sulattaa double helix syömällä ja laajentaa yksi osa, kuten nähdään tämän rakenteen.
Tutustuen Rakenne
toinen proteiini, helicase loader, auttaa aloitteentekijä ja valvo replicative DNA helicase päälle yhden lohkon., Rakenne kuvassa (ATE merkintä 4m4w ) sisältää DNA helicase (sininen), helicase loader (magenta) ja pieni toimialue primase (vihreä), entsyymi, joka rakentaa lyhyt RNA-primer, joka saa replikointi alkoi. Tämä matalan resoluution rakenne oli ratkaista käyttämällä atomic-resoluution rakenteita yksittäisten komponenttien, ja osoittaa mielikuvia aukko rengas helicase alayksiköstä, jotka voivat olla sivuston maahantulon yhden lohkon DNA. Tutkia rakennetta tarkemmin, klikkaa kuvaa interaktiivinen Jmol.,
Aiheet käydään Keskustelua
- Useita muita rakenteita helicases avulla sidottu single-pulaan DNA ovat saatavilla ATE, mukaan lukien bakteeri-DNA helicase Edustaja, joka toimii dimeeri (merkintä 1uaa).
- DnaA on verkkotunnuksen, joka sitoutuu kaksijuosteisen DNA: n, käärimistä se noin ulkopuolella DnaA kokoonpano. Tämän verkkotunnuksen rakenne, joka on sidottu kaksinkertaiseen DNA: han, on saatavilla PDB-merkinnässä 1j1v.,
- rakenne helicase loader DnaC on huomattavan samanlainen rakenne DnaA, muodostaen vastaavia helix alayksikön. Voit käyttää ”Vertaa Rakenteita” työkalu päällekkäin nämä kaksi rakenteet, vuonna ATE merkinnät 3ecc ja 3r8f.
Liittyvät ATE-101 Resursseja
- Lisää DNA Helicase
- Selaa Proteiinisynteesiä
- 4m4w: B. Liu, W. K. Eliason & T. A., Steitz (2013) helikaasi-helikaasikuormaajakompleksin rakenne paljastaa oivalluksia bakteerien primosomi-kokoonpanon mekanismista. Luontoviestintä 4: 2495.
- 4esv: O. Itsathitphaisarn, R. A. Siipi, W. K. Eliason, J. Wang & T. Steitz (2012) hexameric helicase DnaB hyväksyy nonplanar lihakkuus aikana translokaatio. Selli 151, 267-277.
- P. Soultanas (2012) rengas helicaasien Lastausmekanismit replikaatioperustassa. Molekyylibiologia 84, 6-16.
- 3r8f: K. E. Duderstadt, K. Chuang & J. M., Berger (2011) bakteerin alustajien DNA-venyttely edistää replikaatioalkuperän avautumista. Luonto 478, 209-213.
. joulukuuta 2013, David Goodsell
doi:10.2210/rcsb_pdb/mom_2013_12
Noin Molekyyli Kuukauden
– Se RCSB ATE Molekyyli Kuukauden David S. Goodsell (Scripps Research Institute ja RCSB ATE) esitetään lyhyt tilejä valitut molekyylit Protein Data Bank., Jokainen erä sisältää johdannon rakennetta ja toimintaa molekyyli, keskustelun merkitys molekyylin ihmisten terveyttä ja hyvinvointia, ja ehdotuksia siitä, miten kävijät voivat tarkastella näitä rakenteita ja tutustua lisätietoja. Lisää
Leave a Reply