Molekula a Hónap
kategóriák | Dátum | Cím |
DNS helicase pries egymástól a két szál, a DNS kettős spirál, powered by ATP
töltse le a kiváló minőségű TIFF képet
genetikai információink biztonságosan bezáródnak a DNS kettős spiráljába. Ennek az információnak a felhasználásához a hélixet le kell tekerni a bázisok feltárására, lehetővé téve a polimerázok számára, hogy kiegészítő DNS-vagy RNS-szálakat építsenek ki. A DNS leválása trükkösebb, mint amire számíthatsz. A bázisok közötti kölcsönhatás meglehetősen erős, sok közülük van, ezért észrevehető energiára van szükség a szálak elválasztásához. Ez a DNS helikázok feladata: olyan enzimek, amelyek a két szálat egy DNS kettős spirálban szétszedik.,
replikatív helikázok
az itt bemutatott helikáz a PDB 4esv bejegyzésből elválasztja a DNS-szálakat egy bakteriális genom replikációja során. A kromoszóma egy kör, a replikáció A kör egy pontján kezdődik (az úgynevezett” eredet”), mindkét irányban folytatódik, az ellenkező oldalon befejezve. A helikáz körül egy szálú része a DNS (itt látható narancssárga) és hüvelyk az utat a szál mentén, elválasztva a kettős hélix, ahogy megy. ATP-t használ (piros színnel látható) a mozgás táplálására.,
Környező DNS
DNS-Replikációs helicases tagjai egy nagy osztály, a fehérje motorok használja az ATP nyomja fehérjék vagy nukleinsav keresztül egy gyűrű a fehérje alegységek. Ezek az enzimek általában két kategóriába sorolhatók: a baktériumok hasonlóak a RecA-hoz, amely a genetikai rekombinációban részt vevő fehérje, replikatív helikázaink AAA+ Atpázok, hasonlóan az AAA+ proteázokhoz. Mindkét esetben a komplex olyan alegységek gyűrűjét képezi, amelyek körülveszik a DNS egyetlen szálát., Az itt látható replikatív helikáz hat azonos alegységből áll, amelyek egy lezáró alakú komplexet alkotnak,a hat alegységgel a DNS spirálját követve.
olvadó DNS
töltse le a kiváló minőségű TIFF képet
két fehérje segíti a celluláris replikatív helikázokat az egész folyamat elindításában., Az első, úgynevezett kezdeményező, kötődik a replikáció eredetéhez, és a helikázt a megfelelő helyre helyezi. A DnaA, az itt bemutatott iniciátor fehérje (PDB 3r8f bejegyzés) szintén katalizálja a DNS-szálak kezdeti elválasztását. Az alegységek hosszú spirális összeszerelését képezi, és úgy gondolják, hogy két különböző feladatot lát el. Kezdetben a DNS kettős spirál kívülről körbeveszi, szuperhelikus szerkezetet alkotva egy speciális szekvencia mellett, amely az AT-bázispárokban gazdag, így gyengébben kötődik, mint a legtöbb DNS-régió., Ezután a DnaA kötődik az AT-rich régióhoz, segítve a kettős spirál megolvasztását az egyik szál rögzítésével és kiterjesztésével, amint az ebben a struktúrában látható.
Feltárása a Szerkezet
- Kép
- JSmol 1
második fehérje, egy helicase betöltő, segíti a kezdeményező, illetve kísérők, a DNS-replikációs helicase rá a sodrat., Az itt látható szerkezet (PDB entry 4m4w) magában foglalja a DNS helikáz (kék), helikáz rakodó (bíbor) és egy kis domén primáz (zöld), az enzim, amely épít a rövid RNS primer, Hogy lesz replikáció kezdődött. Ez az alacsony felbontású szerkezet volt megoldva segítségével atomi felbontású struktúrák, az egyes elemek mutatja felidéző rés a gyűrű a helicase alegységek, amelyek lehetnek oldalon a bejegyzés a DNS egyetlen szála. Ha részletesebben meg szeretné vizsgálni ezt a struktúrát, kattintson a képre egy interaktív Jmol-hoz.,
Témák További Vita
- Több más struktúrák helicases köteles egyszálú DNS állnak rendelkezésre az EKT, beleértve a bakteriális DNS-helicase Rep úgy működik, mint egy dimer (bejegyzés 1uaa).
- a DnaA-nak van egy doménje, amely kötődik a kettős szálú DNS-hez, a DnaA szerelvény külső része köré csomagolva. Ennek a doménnek a kettős szálú DNS-hez kötött szerkezete elérhető az 1J1V PDB bejegyzésben.,
- a helicase loader dnac szerkezete rendkívül hasonló a DnaA szerkezetéhez, hasonló alegységek spirálját képezve. Használhatja az “összehasonlítás Struktúrák” eszköz, hogy átfedés a két struktúrák, az EKT bejegyzések 3ecc, valamint 3r8f.
Kapcsolódó EKT-101 Források
- További információk a DNS Helicase
- keresse meg a Fehérje Szintézis
- 4m4w: B. Liu, W. K. Eliason & T. A., A helicase-helicase rakodó komplex Steitz (2013) szerkezete betekintést nyújt a bakteriális primoszóma összeszerelésének mechanizmusába. Nature Communications 4: 2495.
- 4esv: O. Itsathitphaisarn, R. A. Wing, W. K. Eliason, J. Wang & T. Steitz (2012) a hexamerikai helicase dnab transzlokáció során nemplanáris konformációt alkalmaz. 151-es cella, 267-277.
- P. Soultanas (2012) A gyűrűs helikázok replikációs eredetű mechanizmusainak betöltése. Molekuláris Mikrobiológia 84, 6-16.
- 3r8f: K. E. Duderstadt, K. Chuang & J. M., Berger (2011) a bakteriális kezdeményezők által végzett DNS-nyújtás elősegíti a replikáció eredetének megnyitását. Természet 478, 209-213.
2013. December David Goodsell
doi:10.2210/rcsb_pdb/mom_2013_12
Leave a Reply