Ligase Bevezetés

A biokémia, ligase, más néven szintetáz, egy olyan enzim, ami a csatlakozás két nagy molekulák kialakulhatna egy új kémiai kötés, mint például a C-O, C-S, C-N, vagy az köti össze a két vegyületek, általában kíséri a hidrolízis egy kis csatolt kémiai csoport egyik a nagyobb molekulák., Ez az eljárás általában sajátítja el a szükséges energiát a dekoltázs egy energia-gazdag-foszfát bond, magában foglalja a természetvédelmi kémiai energia kínál egy kapcsolat közötti energia-igénylő szintetikus folyamatokat energia-hozamú bontás reakciók. A legtöbb esetben az ATP adenozin ADP-re történő egyidejű átalakítása energiaforrásként működik., A ligáz katalizált reakció általános megfogalmazása a következő:

nómenklatúra

a ligázok közös nevei gyakran tartalmazzák a “ligáz” szót, mint például a DNS-ligázt,a molekuláris biolaboratóriumban gyakran használt enzimet a DNS-fragmensek összekapcsolására. A szintetáz egy másik általánosan elfogadott név a ligázok számára, mivel új molekulák szintézisében alkalmazzák őket. A szintetázokat néha megkülönböztetik a szintetázoktól, néha a szintetázok szinonimájaként kezelik., A meghatározás szempontjából a nukleozid-trifoszfátokat, mint például az ATP, a GTP, a CTP, a TTP és az UTP, szintetázok használják energia előállítására, míg a szintetázok nem használnak nukleozid-trifoszfátokat. Egy szintáz is elismerte, mint egy liáz, hogy katalizálja a dekoltázs, a különböző kémiai kötések révén azt jelenti, kivéve a hidrolízis, majd oxidációs anélkül, hogy a kereslet minden energia, mivel egy szintetáz egy ligase csatlakozott két vegyi anyagok vagy vegyületek, az energia iránti igény., A biokémiai nómenklatúra közös Bizottsága (Jcbn) azt diktálta, hogy a szintetáz bármely olyan enzimet képviselhet, amely katalizálja a szintézist, míg a szintetázt szinonimaként kell használni.

osztályozás

az EK-számosztályozási rendszerben a ligázok EK-6-nak minősülnek, és további hat alosztályba sorolhatók.

Alkalmazások Több Közös Ligases

DNS ligase egy bizonyos típusú enzim, amely elősegíti a csatlakozás a DNS-szál össze, ami a formáció egy phosphodiester kötelék-foszfát, illetve deoxyribose. A DNS-ligáz aktív a DNS replikációs, javítási és rekombinációs folyamata során., Széles körben alkalmazzák a javítás egyszálú szünetek duplex DNS élő szervezetek segítségével a kiegészítő szál a kettős spirál, mint a sablon, míg egyes formák kifejezetten orvosolni kettős szál károk. A molekuláris biológiai laboratóriumokban a tisztított DNS-ligázt széles körben használják a gén klónozásában, hogy összekapcsolják a DNS-molekulákat rekombináns DNS kialakításához. A DNS-ligáz egy másik innovatív alkalmazása a nano-kémia területén látható, különösen a DNS-origami esetében., A DNS-ligáz enzimes segítséget nyújthat, amely elengedhetetlen a DNS-rácsszerkezet felépítéséhez a DNS felett, így tovább szerelhető a nanomachinok, a nanoelektronikai, a biomolekulák és a fotonikus komponens.

a ligáz egy másik tipikus példájaként a T4 RNS ligáz 1 képes katalizálni az RNS egyszálú 5′-foszforil termini egyszálú 3′-hidroxil termini RNS-hez való ATP-függő kovalens csatlakozását., T4 RNS ligase 2 különbözteti kritikus aláírás maradványok, valamint egyedi C-terminális domén, amely elengedhetetlen a tömítés 3′-OH, 5′-phosphoryl RNS-szálat is katalizálja a csatlakozás egy 3′-hidroxil végén RNS 5′-phosphorylated RNS. A T4 RNS-ligáz 1-gyel ellentétben inkább a kettős szálú szubsztrátumokat részesíti előnyben, és a T4 RNS-ligáz 2 csonka formájában egy előre adenilált szubsztrátra van szükség a ligáláshoz. A T4 RNS-ligáz képes RNS 3′-end-et citidinnel 3′,5′ – bisz-foszfáttal címkézni, szintetikus oligonukleotidok keringését indukálja, és helyspecifikusan kompozit primereket hoz létre PCR-hez., A trnas specifikus módosításai a T4 RNS ligáz segítségével is elvégezhetők, amely szintén katalizálta az oligodeoxiribonukleotid egyszálú cDNAs-hoz való kötődését az 5′-RACE-hez.

az Ubiquitin ligáz, más néven E3 ubiquitin ligáz, egyetlen polipeptidként vagy multimerikus komplexként létező enzim. Az E3 Ubiquitin ligáz együtt működhet az ubiquitin aktiváló E1 enzimmel és az ubiquitin konjugáló E2 enzimmel, amelyet ubiquitinnel töltöttek be, hogy felgyorsítsák a különböző fehérje szubsztrátok ubiquitinációját a proteaszóma általi célzott lebomlás érdekében., Az ubiquitin végső soron a szubsztrátfehérjén található lizinhez kapcsolódik, bár az izopeptidkötés és az E3 ligázok kölcsönhatásba léphetnek mind a célfehérjével, mind az E2 enzimmel, ezáltal szubsztrát specifitást adva az E2 enzimnek. Ubiquitination által E3 ubiqutin ligázok is fontos szerepet játszik a szabályozás számos biológiai folyamatok, mint például a sejtkereskedelem, DNS javítás, jelzés. Nagyon fontos a sejtbiológiában. Az E3 ligázok szintén helyet foglalnak el a sejtciklus-kontrollban és a ciklinek lebomlásában., Az emberi genom több mint 600 feltételezett E3 ligázt kódol, ami óriási változatosságot eredményez a szubsztrátumokban, míg az E3s meghatározhatja a fehérje szubsztrátok specifitását. A legújabb kutatások azt találták, hogy sok E3-as érintett az emberi betegség, és ők egy osztály vonzó “gyógyszerezhető” célok gyógyszerészeti beavatkozás.

Kiemelt termékek

Ligázák