PMC (Suomi)

varsinainen Teksti

Synnynnäinen yleistynyt hypertrikoosi (CGH) on geneettisesti ja fenotyyppisesti heterogeeninen ryhmä harvinaisia sairauksia ominaista universaali karvojen liikakasvua. Se on monien erillisten geneettisten oireyhtymien tärkein fenotyyppinen ominaisuus, ja se voidaan periä autosomaalisena tai X-linkittyneenä hallitsevana piirteenä.,1-5 CGH-fenotyyppi on herättänyt paljon tieteellistä kiinnostusta ja mediahuomiota, pitkälti huomiota herättävän karvaisen fenotyypin ja sen ilmeisen atavistisen luonteen vuoksi.6,7 tähän mennessä geenivirheitä on löydetty kahdesta autosomaalisesti dominoivan CGH: n muodosta. Autosomaalinen hallitseva synnynnäinen yleistynyt hypertrikoosi terminalis kanssa tai ilman ikenen liikakasvu (MIM 135400) liittyy copy-useita muunnelmia (CNVs), joko microdeletions tai microduplication, kromosomissa 17q24 sekä familiaalinen ja satunnaisia tapauksia.,5 Uudelleenjärjestelyt kromosomi 8 ja mahdollista kanta vaikutus on havaittu hypertrikoosi universalis congenita, Ambras tyyppi (MIM 145701).8 Figuera ym. kartoitettu ensimmäisen CGH locus kromosomipoikkeavuuksia Xq24-q27.1 vuonna 1995 suuri Meksikolainen perhe erottelevat X-kromosomiin hypertrikoosi (MIM 307150).3 sen Jälkeen, geneettinen kartoitus oli vahvistettu Meksikon suku, jossa on X-kromosomiin synnynnäinen hypertrikoosi oireyhtymä, joka koostuu CGH, kuurous, ja hampaiden poikkeavuuksia.4 taustalla oleva mutaatio jää kuitenkin tunnistamatta.,

Genomista häiriöt ovat kasvava luokan ihmisen häiriöt, jotka johtuvat genomien uudelleenjärjestely, joka voi johtaa täydellinen menetys tai voitto geeni(t) herkkä annostus vaikutus tai, vaihtoehtoisesti, saattaa häiritä rakenteellisen eheyden geeni.9 Mikrodeleetit ja mikroduplikaatiot liittyvät useimmiten ihmisen genomisiin häiriöihin.,9-11 Toinen tyyppi genomien uudelleenjärjestely, nähnyt harvemmin, on interchromosomal lisäys, jossa on intercalation osa yksi kromosomi toiseen, nonhomologous kromosomi ja on myös nimitystä interchromosomal insertional translokaatio.12

Viime soveltaminen massively parallel sequencing (MPS) ja korkean resoluution genome-wide CNV-analyysi on nopeasti purkaa geneettinen perusta monia harvinaisia Mendelin ja genomin häiriöistä.,10-14 Täällä, me lisätä X-kromosomiin synnynnäinen hypertrikoosi oireyhtymä, joukossa harvinaisin harvinainen ehtoja, luettelo näiden häiriöiden raportointi tunnistaminen itsenäinen interchromosomal lisäyksiä, joissa eri autosomaalinen segmentit välittyy sama pieni palindromi klo Xq27.1 kussakin kaksi X-kromosomiin CGH perheistä, eri etnisistä taustoista.

– Meidän on ensin selvitettävä viiden sukupolven Kiinalaisen perheen kanssa erillinen oireyhtymä CGH, skolioosi, ja spina bifida (Kuvat 1A ja 1B). Perheessä oli 11 sairastunutta yksilöä (Kuva 1a)., Kaikki neljä vaikuttaa miehillä saatavilla fenotyypin arviointi oli vaikeaa hypertrikoosi liittyy skolioosi, ottaa huomioon, että kaikki vaikuttaa naisilla oli vain lievä hypertrikoosi, joka oli sopusoinnussa sen kanssa, X-kromosomiin kytkeytynyt periytyminen (Kuvat 1B–1D). Proband, 41-vuotias mies, oli myös spina bifida esittelee kohdunkaulan ja ristinikaman meningoceles (Kuva 1C). Muilla kymmenellä sairastuneella yksilöllä ei ollut selkärankahalkiota., Me kerätään verinäytteet 19 osallistuvat perheen jäsenet (kahdeksan vaikuttaa, seitsemän ennallaan, ja neljä puolisot) saatuaan tietoon perustuvaa suostumusta osallistujilta ja hyväksyntää Pekingin Unionin Medical College institutional review board. Chorionic villus-näytteenotto tehtiin osallistujalle V1 (Kuva 1a). Genominen DNA uutettiin standardimenetelmillä., Onko X-kromosomiin synnynnäinen hypertrikoosi oireyhtymä on kartoitettu samaan locus kuten raportoitu aiemmin Meksikon CGH perhe,3 määrittelimme genotyypit 17 perheenjäsenten klo 14 polymorfinen mikrosatelliitti merkki loci päässä Xq26.3-q27.2-alueella (Taulukko S1 saatavilla verkossa), joista 11 oli suunniteltu käyttö UCSC Human Genome-Selain. Kahden pisteen sidos analyysi ja LOD pisteet laskenta toteutettiin MLINK ohjelman SIDOS-paketti ohjelmisto (versio 5.2)., Käytetyt parametrit sidos analyysi oli X-sidoksissa hallitseva perintö, täydellinen penetrance, mutaatio korko on nolla, tasa-mikrosatelliitti-alleelia taajuus, ja sairaus-alleelia taajuus 1 10 000: sta. Meidän kahden pisteen sidos analyysi tuotti maksimi LOD-pistemäärä 3.91 klo θ = 0 viisi markkereita (Taulukko S2), vahvistaa geneettisen kytkennän samaan locus Kiinan perhe. Perusteella haplotyypit, havaitsimme kaksi rekombinaatiotapahtumia, yksi III5 ja muut IV2 (Kuva S1)., Edelleen haplotyyppi analyysi näiden kahden recombinants määritelty kriittinen alue väli ZLS3 ja ZLS10, eli genomista välein 5.6 Mb sisältää 40 RefSeq geenit (Kuva 1E ja Kuva S1). Me tehdään PCR-monistus ja sekvensointi kaikkien eksonien ja niiden reunustavat intronic sekvenssit näiden geenien proband (Kuva 1E; primer tietoa on saatavilla pyydettäessä), mutta ei tunnistaa mitään patogeeninen mutaatio.,

Fenotyypit ja Geneettinen Locus of Erillinen X-kromosomiin Synnynnäinen Hypertrikoosi Oireyhtymä

(A) Sukupuuta viiden sukupolven Kiinalaisen perheen kanssa yksitoista vaikuttaa yksilöiden. V1: lle diagnoosi tehtiin korionisesta villus-näytteestä. Henkilöt, joiden DNA: ta oli saatavilla, on merkitty merkinnällä ”+.”

B) luotaimen kuva, jossa näkyy vakava CGH.

(C) Valokuva-ja MRI-kuva näyttää kohdunkaulan meningocele vuonna proband.

(D) röntgenkuva kokelaasta, jossa näkyy skolioosi.

(E) kaavio Xq26: sta.,3-q27.2 x-linkitetyn synnynnäisen hypertrichosis-oireyhtymän kriittisen alueen RefSeq-geenit. Vankka sininen palkki edustaa kriittistä aluetta. Kaikkien yhteysanalyysissä käytettyjen geneettisten merkkiaineiden kannat on esitetty.

määrittää, onko X-kromosomiin synnynnäinen hypertrikoosi oireyhtymä on aiheuttanut tuntematon microdeletion tai microduplication, me tehdään genome-wide korkean resoluution CNV scan neljän vaikuttaa yksilöiden (kaksi urosta ja kaksi narttua), käyttäen Affymetrix Genome-Wide Ihmisen SNP Array 6.,0 sisältää yli 906,600 SNPs ja yli 946,000 copy-useita luotaimia. Genomien DNA-näytteitä neljä vaikuttaa yksilöiden (kaksi urosta, II9 ja III5; ja kaksi narttua, III3 ja IV2) oli genotyypitetty, että CapitalBio Corporation (Peking, Kiina), jossa SNP Array 6.0 mukaisesti valmistajan protokollia. Genotyyppipuhelu, genotyyppien laadunvalvonta ja CNV-tunnistus suoritettiin Affymetrix Genotyyppikonsoli 3.0-ohjelmistolla. Copy-number-state-puhelut määritettiin Affymetrix Genotyping Console 3.0-pakettiin upotetulla Kanarian algoritmilla., Meillä ei havaita mahdollinen patogeenisten CNVs kriittisellä alueella, mutta löysi >121 kb microduplication ja COL23A1 keskitytään 5q35.3 (CN_143030 että CN_1143071) kaikki neljä henkilöä (Kuva 2A).

Tunnistaminen Perinnöllinen Interchromosomal Lisäys klo Xq27.1 Kiinan Perheen kanssa Erillinen X-kromosomiin Synnynnäinen Hypertrikoosi Oireyhtymä

(A) Kopioi-numero tila 600 kb genomin alueen kromosomi 5q35.3 osoittaa läsnäolo microduplication vuonna proband. CN, kopio numero.,

B) mikrotuplikaation validointi ja sen erottelu taudin fenotyypin kanssa qPCR: n avulla. RCN, suhteellinen kopionumero. Virhepalkit edustavat SD.

(C ja D) Kaksi-väri KALA signaaleja edustaja interphase ydin (C) ja tyypillinen metafaasissa kromosomit (D) osoittaa lisäys tapahtuma. BAC anturit ovat CTD-2507I18 (punainen), RP11-55E17 (vihreä), ja RP11-671F22 (vihreä). Katso kuva 4a simpukoiden asennoista.

– (E ja F) Sekvenssin analyysi proksimaalisen (E) ja distaalisen (F) lisäys liittymissä. Vertailujaksot Xq27. 1 ja 5q35.,3 on merkitty punaisella ja sinisellä vastaavasti. Proksimaalinen liitos sisältää X-kromosomin (musta) ja 2 bp: n mikroinsertion (vihreä), jonka alkuperä on tuntematon.

(G) PCR-vahvistus distaalisesta insertiointiliitoksesta, joka osoittaa insertion eriytymistä fenotyypin kanssa.

kaikki genomiset kannat vastaavat helmikuun 2009 human reference sequencea (GRCh37).

vahvista genomista päällekkäisyyttä 5q35.3-alueittain, me suunniteltu alukkeet reaaliaikainen kvantitatiivinen PCR (qPCR) – määritys käyttämällä Primer Express v2.,0 software (Applied Biosystems). Esitimme qPCR: n aiemmin kuvatulla tavalla.15 kohdesarjojen suhteellinen kopioluku (RCN) määritettiin vertailevalla ΔΔCT-menetelmällä. A ∼1,5-kertaista RCN: ää käytettiin päällekkäisyyksiin. QPCR-kokeita toistettiin kolme kertaa. QPCR-määrityksissä käytetyt primerit on esitetty taulukossa S1. Meidän qPCR-määritystä vahvisti microduplication ja osoitti myös koko erottelun microduplication taudin fenotyyppi perhe (Kuva 2B), mikä viittaa siihen, mahdollinen interchromosomal lisäys tapahtuman sisällä kriittinen alue.,

Me tehdään kaksi-väri interphase, ja metafaasissa fluoresenssi in situ hybridisaatio (FISH) vahvista lisäys Kiinan perhe. Bakteeri keinotekoinen kromosomi (BAC) kloonien CTD-2507I18, RP11-55E17, ja RP11-671F22 valittiin kattamaan monistaa alueella COL23A1 (MIM 610043) on 5q35.3, FHL1 (MIM 300163) on Xq26.3, ja F8 (MIM 300841) on Xq28, vastaavasti (Kuva 4A). Se RP11-55E17 ja RP11-671F22 BAC-DNA-näytteet olivat erikseen merkitty SpectrumGreen-dUTP (Abbott Molecular), ja CTD-2507I18 DNA oli merkitty Cy3-dUTP (GE Healthcare Life Sciences)., Se interphase ytimet ja metafaasissa kromosomit olivat cohybridized pari SpectrumGreen-dUTP-merkitty viite anturit (vihreä merkki) ja Cy3-dUTP-merkitty testi probe (punainen merkkivalo), counterstained kanssa DAPI, ja visualisoitu fluoresenssi mikroskopia., Kaksi-väri KALA signaalin kuviot havaittu sekä interphase ytimet (Kuva 2C) ja metafaasissa kromosomit (Kuva 2D ja Kuva S2) olivat yhdenmukaisia interchromosomal lisäys tapahtuma, kuten läsnäolo punainen signaalit COL23A1 kromosomissa 5 homologeista, jotka kiehuvat ja X-kromosomissa välillä vihreä signaaleja, jotka vastaavat FHL1 on X26.3 ja F8 Xq28 (Kuva 2D ja Kuva S2).,

Interchromosomal Lisäyksiä Välittyvät Saman Ihmisen Erityisiä Palindromi

(A) Kaaviokuva kuvaa kahden riippumattoman lisäyksiä löytynyt tässä tutkimuksessa. Punaiset kiinteät palkit edustavat lisättyjä sirpaleita, ja merkityt koot vastaavat emäspareja (bp). Punaiset viivat näyttävät insertioiden suunnan. Kannat BAC luotaimia käytetään kaksi-väri KALA ja RefSeq geenejä vastaava kromosomi-alueet ovat osoittaneet.,

(B) Kaaviokuva 180 bp ihmisen erityisiä palindromi, jossa on yhteenveto raja-arvot määritellä tässä tutkimuksessa. Kiinteät kolmiot osoittavat insertion raja-arvot kahdessa tutkimuksessa perheet (Kiinan punainen ja Meksikon vihreä). Jbpcn, junction breakpoint kiinalaisessa perheessä; JBPmx, junction breakpoint meksikolaisessa perheessä. Avoimet kolmiot edustavat normaalien yksilöiden poistomurtumia (kiinaksi punaisella, Meksikoksi vihreällä ja Yoruban mustalla). Musta kiinteä tanko edustaa LINE-1-elementtiä, joka sisältää proksimaalisen JBPcn: n., JBPcn: n tarkka sijainti annetaan.

(C) Kaaviokuva osoittaa pienen ihmisen erityisiä palindromi klo Xq27.1 ja sen reuna-alueet. 180 bp: n palindromijakso on boksattu. Simpanssilla on kaksi palindromin puolikasta, mutta suorassa suunnassa. Kaikilla muilla kolmella kädellisellä on vain puolet palindromista.

kaikki genomiset kannat vastaavat helmikuun 2009 human reference sequencea (GRCh37).,

samanaikaisesti edellä kuvatun CNV ja KALAT analyysit, teimme kohdennettuja kaapata ja KANSANEDUSTAJIEN proband käyttämällä Roche NimbleGen SeqCap-ja 454-Sekvensointi-teknologiaa. Kaksi custom Järjestyksessä Kaapata 385K ihmisen ryhmät olivat ensimmäinen suunniteltu ja valmistettu Roche NimbleGen, joilla kullakin on 385,000 ainutlaatuinen SeqCap antureista, kuten määräytyy SSAHA algoritmi, joka kattaa 88.1% kohdennettuja kriittisen alueen välillä ZLS3 ja ZLS10 (chrX: 135,204,482–140,853,096; GRCh37, hg19) (Kuva 1E)., Vangittu DNA sekvensoitiin Genomisekvensseri FLX-järjestelmään, jossa oli pitkään luettu GS FLX-Titaanisarjan kemia Roche 454 biotieteissä. Tuloksena järjestyksessä lukee oli kartoitettu hg18 ihmisen viittaus GS Viite Mapper ohjelmisto ja oli 555 Mt järjestyksessä tiedot noin 98% kartoitettu takaisin kohdennettuja alueella. Edelleen analyysi 454 GS Viite Mapper-ohjelmisto kävi ilmi, distaalinen lisäys risteyksessä sekvenssit (Kuva S3), paikallistaa murtuessa sisällä X-kromosomi (chrX: 139,502,951) keskustaan 180 bp lyhyt palindrominen sekvenssi Xq27.,1, joka sijaitsee 82 kb alavirtaan SOX3 (MIM 313430) (Kuva S2, kuvat 4A ja 4B). Käytimme pitkän kantaman PCR täydentää lisäys liittymissä. Alukkeet oli suunniteltu sekvenssit reunustavat palindromi klo Xq27.1 ja raja-arvojen perusteella SNP Array 6.0 genomista koordinaatit., Järjestyksessä analyysin tuloksena amplicons, joita Sanger sekvensointi todentaa distaalinen risteyksessä löydy kohdennettuja genomien sekvensointi (Kuva 2F), sijoitetaan toinen X-kromosomi murtuessa muodostavat johtimen lisäys risteyksessä keskellä LINE-1 elementti vieressä pieni palindromi (Kuva 2E ja Kuva 4B), ja ilmoitti, että mutantti X-kromosomissa oli suora lisäys on 125,577 bp-fragmentti sisällä COL23A1 (Kuvat 2E ja 2F, Kuva 4A), eli, der(X)dir ins(X;5)(q27.1;q35.3)., Tämän lisäyksen osoitettiin esiintyvän samanaikaisesti 1263 bp: n poistumisen kanssa X-kromosomin kahden keskeytyspisteen välillä Xq27.1 (kuvat 2e ja 2F). Sopusoinnussa qPCR-määritystä, meidän junction-PCR-menetelmällä perheen osoitti erityisiä fragmentteja odotettavissa kokoa kaikki vaikuttaa yksilöiden, mutta ei vaikuta perheen jäsenet (Kuva 2G).

löytö lisäys välittyvät lyhyen palindrominen sarjakuvaus Kiinan perhe sai meidät tutkimaan alun perin raportoitu X-kromosomiin Meksikon CGH perhe (Kuva 3A). SNP-järjestelmän käyttö 6.,0 tutkimiseen neljä perheen jäsentä (kaksi vaikuttaa ja kaksi ennallaan) varten CNVs paljasti microduplication a >278 kb fragmentti 4q31 (SNP_A-2053483 että SNP_A-1883747), joka kattaa PRMT10 ja TMEM184C ja joissa osat ARHGAP10 (MIM 609746) ja EDNRA (MIM 131243), joka vaikuttaa jäsenten (Kuva 3B ja Kuva 4A). Me validoitu tämä microduplication, jonka qPCR-määritystä (Kuva 3C) ja saatu murtuessa tietoja käyttämällä samanlaisia risteyksessä PCR-lähestymistapa (Kuvat 3D ja 3E)., Tulokset ehdotti, että vaikuttaa jäsenet Meksikon perhe oli perinyt mutantti X-kromosomi, jossa ylösalaisin lisätään 300,036 bp katkelma 4q31.22-q31.23 alueella (Kuvat 3D ja 3E, Kuva 4A), eli, der(X)ins inv(X;4)(q27.1;q31.23q31.22). Tutkimus kaikki saatavilla olevat perheen jäsenet lisäys käytön risteyksessä PCR-testi vahvisti erottelun insertional tapahtuman CGH fenotyyppi (Kuva 3F)., Erittäin mielenkiintoista, sekä kaksi X raja-arvot tunnistettu Meksikon perhe olivat keskiössä palindromi (chrX: 139,502,951 ja 139,502,958) (Luvut 3D ja 3E, Kuvio 4B), mikä vahvistaa asemaa tämän pienen palindromi välittäjänä aloittamisen kaksi lisäyksiä tunnistettu tässä tutkimuksessa.

Tunnistaminen Perinnöllinen Interchromosomal Lisäys klo Xq27.1 Meksikon Perhe, jossa on X-kromosomiin CGH

(A) Sukutaulu viisi sukupolvea Meksikolaisen perheen kanssa, X-kromosomiin CGH., Henkilöt, joiden DNA: ta oli saatavilla, on merkitty merkinnällä ”+.”

(B) Kopioi-numero tila 600 kb genomin alueen kromosomi 4q31 osoittaa läsnäolo microduplication vaikuttaa yksilön. CN, kopio numero.

(C) qPCR: n suorittama mikrotuplikaation validointi. RCN, suhteellinen kopionumero. Virhepalkit edustavat SD.

(d ja E) proksimaalisten (D) ja distaalisten (E) insertioliitosten Sekvenssianalyysi. Viite sekvenssit Xq27.1 ja 4q31 on merkitty punainen ja sininen, vastaavasti. Distaalinen risteys sisältää 25 bp: n mikroinsertion.,

(F) proksimaalisen insertiointiliitoksen PCR-vahvistus, joka osoittaa insertion eriytymistä fenotyypin kanssa.

kaikki genomiset kannat vastaavat helmikuun 2009 human reference sequencea (GRCh37).

– Olemme tunnistaneet riippumaton lisäyksiä välittyy sama pieni palindromi klo Xq27.1 kahden eri perheiden sairastaa X-kromosomiin hypertrikoosi. Lisäksi näiden insertioiden täydellinen erottelu fenotyyppien kanssa on antanut lisätukea niiden syy-seuraussuhteeseen., Onko nämä lisäykset olivat ainutlaatuisia nämä perheet ja sulkea pois mahdollisuus niiden, jotka edustavat normaalia perimän vaihtelua väestössä, me seulotaan 740 mies hallita yksilöitä (215 Kiinan, 118 Meksikon, ja 407 Aasian Intian) PCR-alukkeita, jotka on johdettu sekvenssit reunustavat palindromi (Taulukko S1), ja löysimme mitään havaittavaa lisäys., Lisäksi CNVs joissa kaksi tunnistettu asetettu segmentit eivät ole raportoitu julkinen Tietokanta Genomista Variantteja ja eivät ole läsnä 1274 Kiinan valvonta yksilöiden (1074 Shanghaista ja 200 Hong Kong). Yhdessä meidän tulokset viittaavat siihen, että palindromi-välitteisen lisäyksiä ovat perimmäinen syy eristetty ja syndromic X-kromosomiin CGH.

Palindromisekvenssit eivät ole stabiileja, ja ne voivat aiheuttaa genomien uudelleenjärjestäytymistä, mukaan lukien poistot ja toistuvat translokaatiot.16-18 180 bp palindrominen sekvenssi on läsnä vain ihmisillä., Sitä reunustavat viiva-1-kertaus ja LTR-sekvenssi (Kuva 4C). Tarkastelu orthologous alueella simpanssin genomin paljastaa puolikkaat palindromi, mutta ne ovat suora suunta ja erotetaan LTR-sekvenssi. Muut muilla kädellisillä, kuten orangin, rh, ja silkkiapinat, on vain yksi puoli palindromi (Kuva 4C). Nämä tulokset viittaavat siihen, että palindromi on evolutiivisesti hyvin nuori., Edellä mainittujen PCR-analyysi hallita yksilöitä ei kuitenkaan havaita poistot kooltaan 173 bp 9104 bp yhdeksän henkilöä (kaksi Kiinalaista, kaksi Meksikolaista, ja viisi Aasian Intian) (Taulukko S3). Lisäksi poistetaan 209 bp oli nähtävissä Yoruban yksittäisten kohdistuu koko-genomin sekvensointi.19 huomattava, kaikki nämä kymmenen poistot oli yksi keskeytyspiste keskellä palindromin (taulukko S3), mikä poistaa puolet palindromin. Näyttää siis siltä, että ihmisen erityisiä palindrominen sekvenssi Xq27.,1 on altis rikkoutuminen ja siten edustaa hotspot genomista uudelleenjärjestelyjä, mukaan lukien lisäys.

On interchromosomal lisäys tapahtuma vaatii vähintään kolme rikkoutuminen tapahtumia ja näin ollen ei ole vain harvinaisempia, mutta myös monimutkaisempia verrattuna yleisimpiä genomista uudelleenjärjestelyt (microdeletion, microduplication, ja terminaali translokaatio). Aiemmissa mikroskoopillisesti näkyvien interkromosomaalisten insertioiden tutkimuksissa niiden esiintyvyydeksi arvioitiin 1: 80 000 elävänä syntynyttä.,20 Kuitenkin viime aikoina, korkean resoluution array-pohjainen vertaileva genominen hybridisaatio (aCGH) – analyysi ja uudistetut KALAN 18000 kliiniset näytteet tunnistettiin 40 interchromosomal lisäykset (1:500), mikä osoittaa, että ne eivät voi olla yhtä harvinainen kuin aiemmin on ajateltu.12 Interkromosomaalista insertiota voi tuottaa taudin fenotyypin muuttamalla geenin aktiivisuutta. Jos insertion sisällä oleva geeni(t) on annosherkkä, sen ilmentymistä voidaan lisätä. Insertiotapahtuma voi häiritä geeniä ja aiheuttaa joko menetyksen tai toiminnan vahvistumisen., Poikkeava ilmaus geeni, voi aiheuttaa lisäys romaani järjestyksessä sisällä tai lähellä geeni, koska joko aseman vaikutus tai käyttöönotto uusien sääntely-sekvenssit. Spontaani Tanssija (Dc) hiiri mutantti, interchromosomal lisäys ensimmäinen introni ja Tbx10 on genomista fragmentti, joka sisältää p23 promoottori voi aiheuttaa kohdunulkoinen Tbx10 ilme, mikä tuottaa huuli-ja levy homotsygootit.,21 yhdistämällä korkean resoluution microarray-pohjainen CNV skannata ja kohdennettuja genomien sekvensointi, pystyimme löytämään riippumaton patogeenisten lisäykset X-kromosomiin CGH. Kaksi lisäys tapahtumat olivat osoittaneet välittyvän sama pieni palindromi, joka sijaitsee 485 kb geeni-aavikon alueella reunustaa telomerically, jonka SOX3 koodauksen SRY (sukupuoli määritetään alueen Y)-ruutuun 3 transkriptio tekijä (Kuva 4A)., SOX3 on kaikkein kiehtova ehdokas geeni, koska sen 3′ loppuun piilee 82 kb telomeric, että palindromi ja SOX-perheen transkriptiotekijät on yksi tärkeimmistä ryhmät kehityshäiriöitä sääntelyviranomaisten. Edellytämme, että palindromi-välitteisen lisäyksiä tunnistettu tässä tutkimuksessa saattaa olla käyttöön kudos-erityinen sääntely-elementtejä ja näin ollen aiheuttama kohdunulkoinen ilmaus SOX3 karvatupet (HFs) tai esiasteisiin, mikä saattaa aiheuttaa poikkeavaa kuviointi hiukset ja johtaa epänormaali fenotyyppi.,

Mutaatioita SOX3 on liittynyt X-sidoksissa kehitysvammaisuus eristetty kasvuhormonin puutos (MIM 300123),22 ja myös X-kromosomiin hypopituitarismi (MIM 312000).23 Microduplications kattaa SOX3 on löydetty X-kromosomiin hypopituitarismi.23 X-sidoksissa resessiivinen hypoparatyreoosin (MIM 307700), lisäys on noin 340 kb intragenic fragmentti SNTG2 (MIM 608715) on 2p25.3 osaksi Xq27.1 sivuston 67 kb alavirtaan SOX3 on tunnistettu.24 tämä lisäystapahtuma liittyy 23-25 kb: n poistoon, joka sisältää ihmiskohtaisen palindromin., Aseman vaikutus SOX3 ilme on ehdotettu taustalla patogeeniset mekanismi.24 Recently, Sutton et al. on todettu, genomista uudelleenjärjestelyjä, mukaan lukien microduplications ja poistaminen vuonna SOX3 alueella, kolme potilaat, joilla on XX-mies sukupuoli kääntyminen (MIM 300833), jossa raja-arvot vuonna SOX3 sääntelyn alueella.25 Vaikka tarkkoja raja-arvot näiden uudelleenjärjestelyt eivät ole saatavilla heidän tutkimus, se ei vaikuta siltä, että genomin alueella mukana lisäys tapahtumia raportoitiin tutkimuksessamme on kahdennettu kahdella kolmesta potilaista., Edellä kuvatut potilaat, joilla on X-kromosomiin hypopituitarismi, X-sidoksissa resessiivinen hypoparatyreoosin, tai XX-mies sukupuoli kääntyminen ei ole hypertrikoosi fenotyyppi.23-25 Lisäksi naaraat, joilla on Xq26-k 28 poistot, joka voi johtaa menetykseen SOX3, kehittää ennenaikainen munasarjojen vajaatoiminta 1 (MIM 311360), mutta ei hypertrikoosi.,26-29 Yhdessä nämä tarjota tukea meidän hypoteesi, että X-kromosomiin CGH kanssa tai ilman skolioosi ja spina bifida tuloksia lisäys tapahtumien käyttöön uusia DNA-sääntelyn elementit kussakin liitetään sekvenssit, pikemminkin kuin luoda ”- asennossa, vaikutus” fyysinen erottaminen geeni sen luontainen sääntelyn elementtejä.

SOX3 on läheisesti SOX2 (MIM 184429), geeni, joka koodaa avaimen säädin kantasoluja, mutta toistaiseksi ei ole tiedossa, ilmoitetaan HFs., On osoitettu, että sox2-ilmentävät dermaalipapillasolut määrittelevät hiiren HF-tyypit ja indusoivat HF-morfogeneesiä.30,31 käyttää RT-PCR (Taulukko S1), emme voineet havaita SOX3 mRNA ilmaisun HFs eristetty päänahan ihon kudosta lahjoitti terveillä henkilöillä jälkeen kauneusleikkausten tai ihon näyte otettu olkavarsi proband Kiinalaisen perheen (Kuvio S4). Näin, on järkevää spekuloida, että palindromi-välitteisen lisäyksiä saattaa aiheuttaa kohdunulkoinen SOX3 ilmaisun varhaisessa vaiheessa HF kehitystä., Asetettu fragmentti Kiinan perhe saattaa sisältää muita sääntelyn elementtejä ja siten johtaa muita epämuodostumia, kuten skolioosi. Sattumalta, CNVs on 17q24 lähellä SOX9 (MIM 608160), geeni, joka koodaa olennainen säätelijä HF kantasoluja,32,33 aiheuttaa autosomaalinen hallitseva CGH.5 lisätutkimuksia tarvitaan määrittämään, onko poikkeava ilmaus SOX3 tai SOX9 muuttaa kuviointi hiukset kuin sekaantunut näihin tutkimuksiin.